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百白破疫苗接种的一般反应，主要来自百日咳所含的菌体成分。接种未吸附疫苗 12-24小时，局部可有红肿、疼痛、发痒，个别人注射后注射侧腋下淋巴结肿大；接种含有吸附剂的疫苗，注射局部可形成硬结或无菌性脓肿。偶见皮疹及血管神经性水肿。全身反应主要是出现微热，尤其是接种未吸附疫苗更为常见，但接种后48小时可恢复正常。在发热的同时还可伴有倦怠、嗜睡、烦躁不安等短暂症状。
百白破疫苗接种后的异常反应，也主要与疫苗中的百日咳成分有关。极个别可能发生过敏反应，或惊厥、抽搐、尖声哭叫等神经系统并发症。但是，这类异常反应的发生率极低，并不影响免疫接种方针的推行。

禁忌症
患有中枢神经系统疾病，如脑病、癫痫等或有既往病史者，以及属于过敏体质的人不能接种；发热、急性疾病和慢性疾病的急性发作期应缓种。
接种第一针或第二针后如出现严重反应 (如休克、高热、尖叫、抽搐等)，应停止以后针次的接种。

注意事项
⑴使用时应充分摇匀。如出现摇不散之凝块，有异物，安瓿有裂纹，疫苗曾经冻结，标签不清和过期失效，不可使用。
⑵注射后局部可能有硬结，可用热敷逐步吸收。注射第二针时应更换另侧部位。
⑶应备 1:1000肾上腺素，供偶有发生休克时急救用。

运输及保存
百白破疫苗运输和保存的最适宜温度是 2～8℃，严防冻结。一些研究表明，百白破疫苗冻结后能使吸附于蛋白分子表的氢氧化铝解离，形成铝盐结晶，会降低免疫效果，同时增加接种反应。因此，曾经冻结的疫苗不能再使用。为了防止冻结，百白破疫苗在贮存和运输过程中不能直接接触冰箱内壁和冰排。