轮状病毒肠炎的自然病程一般7-10天。一般来说，预后良好。但近年来的研究不断发现，轮状病毒可以引起全身多脏器的受损。曾报道从病儿肺组织、脑脊液、胸水、腹水中检出了轮状病毒。所以对于小儿的腹泻一定要重视，不能光看到腹泻已止，就认为病已好了。还应在医生指导下做其他相应的检查。
轮状病毒有一定的传染性。病毒主要通过肠道进入（也有专家认为呼吸道也有传播的可能）。在发病最初3天的大便中，病毒的数量最多。被污染的尿布、手、食具、玩具都可能造成孩子之间的传播。
在腹泻期间的婴幼儿要给予足够的饮食以预防营养不良，可吃些平时习惯的食物。当然，不要太油腻或难以消化。目前的研究认为，腹泻地禁食是有害的。可给孩子熬些小米粥，熬得越烂越好。小米粥有补气温胃止泻之功，还可加些胡萝卜泥，既能调味，又能补充维生素A，以协助腹泻的治疗。
如为病毒性肠炎，可服“思密达”，1包分3次口服，连服3日；同时服妈咪爱。2、如无效，应送大便做细菌培养和药敏试验，如被细菌感染，应加用敏感的抗生素，同时加用乳酸菌素片、回春生、促菌生等。3、用500毫升白开水，加一牙膏盖食盐，再加10克白糖，分次喂。还可与淡茶水(绿茶)交替喂。饮食以吃母奶为主，如吃牛奶可以米汤稀释，还可给些藕粉，稀软易消化的食物。4、咳嗽应胸透排除肺炎，佝偻病可静脉注射10%葡萄糖酸钙和肌肉注射维生素D3针剂。必要时去医院打点滴，补充水分，电解质和葡萄糖，以防脱水和酸中毒。
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