某些疾病也会影响排卵，甚至没有卵可以排出。例如：“多囊性卵巢疾病”主要是由于其荷尔蒙失调，造成排卵障碍，甚至不孕。另外，有些染色体异常疾病，如Turnet's症候群，或是早发性卵巢衰竭，则根本没有卵可以排出。
    二、 子宫颈因素：
    子宫颈是精子进入子宫腔的第一个关卡，精子必须以子宫颈粘液为媒介，才能活动并顺利穿过子宫颈管进入子宫腔。如果子宫颈粘液的分泌量、酸碱度或浓稠度出现问题，精子无法穿过子宫颈，也会造成不孕。

    三、 子宫因素：
    整个精密复杂的内分泌变化，包括下视丘、脑下腺和卵巢必须协调运作，才能有完美的生殖功能。卵巢所分泌的荷尔蒙作用于子宫内膜，使其增生、肥厚，主要为受精卵提供肥沃的发育环境，能够植根生长。如果生殖内分泌系统出了问题，就会影响排卵，或是受精卵无法正常着床。

    有部分妇女黄体机能不全，因而太容易受孕。正常妇女黄体期应维持12-15天，如果测量基础体温时，高温期天数少于10天，就应考虑黄体机能不全。

    少数妇女子宫发育不全或是先天畸形，常会造成流产或不孕。此外，子宫内膜有某些病理变化，例如子宫内膜异位症、子宫内膜息肉、子宫内膜下肌瘤、子宫腔粘连、子宫内膜结核症、过敏体质、化学毒素、营养不良或感染等原因，也都会干扰受精卵正常着床，造成流产或不孕。

    四、 输卵管因素：
    输卵管如果不畅通，精子和卵子无法顺利通过，当然就无法怀孕，甚至有子宫外怀孕的担心，这个因素占所有不孕症原因的20％-30％，可以说是女性不孕的最主要原因。

　　只有极少数妇女是因为先天畸形造成输卵管狭窄、阻塞，甚至缺少输卵管，绝大部分病人是由于细菌感染的后遗症，例如骨盆腔炎症、结核菌转移感染或人工流产后感染等原因，造成输卵管阻塞。

    五、 腹膜腔因素：
    由于所有女性内生殖器官都位于腹膜腔，如果腹膜腔存在一些物理或是机械因素妨碍受孕过程，也会影响受孕，例如骨盆腔粘连、子宫内膜异位症等，所造成输卵管解剖构造的改变与破坏，就有可能造成不孕。

    此外，有些不明原因的不孕症，也就是临床找不到任何病因的病人，目前医学研究发现，其腹膜腔液所含的发炎性化学物质，会影响排卵、输卵管蠕动等受孕过程，因而造成不容易受孕。